氯雷他定经肝脏药酶代谢，因此会抑制肝脏药酶活性的药物，如大环内酯类抗生素、抗真菌药酮康唑等，可以缓解氯雷他定的代谢，增加此药的血药浓度，有可能导致不良反应的增加。此外与其他中枢抑制药、三环类抗抑郁药合用或者饮酒可以引起严重的嗜睡，与单胺氧化酶抑制剂合用可以增加氯雷他定不良反应。
氯雷他定是第二代抗组胺药物，和第一代抗组胺药物相比，具有高选择性地抑制抗外周组胺H1受体的作用，无镇静作用，无抗毒蕈碱样胆碱作用，对乙醇无强化作用。氯雷他定及其代谢产物均不易通过血-脑屏障，因此不良反应及与其他药物的相互作用，都会比第一代药物要少。