尿路感染的预防，主要可以从以下几方面着手：
1、行为治疗，包括多饮水、碱化尿液，并注意性卫生，性行为后及时排尿，排解大便以后，从前向后擦拭、清洁肛门，注意内裤卫生、清洁，合理休息等。绝经后的女性可以辅助补充雌激素，但应该在医生指导下进行。
2、可以进行低剂量、长疗程的抗菌药物治疗，在急性发作期治疗1-2周以后，尿细菌培养阴性，就可以开始此抗菌药物预防疗法。使用的抗菌药物可以包括磺胺类药物，以及头孢氨苄、头孢克洛、呋喃妥因、磷霉素、诺氟沙星、氧氟沙星、环丙沙星等。
3、可以使用疫苗接种预防，国外已经研究并生产在临床使用的预防大肠埃希菌的疫苗，可明显减少反复感染发作，不过目前国内尚无此类药品。
4、可以辅助使用一些植物类药物，比如服用蔓越莓制品、免疫增强剂辅助药物，可减少感染复发，但疗效存在争议。