睑板腺囊肿会自行消退。睑板腺囊肿是无菌性慢性肉芽肿，考虑是睑板腺管道阻塞引起的分泌物潴留，潴留于睑板腺内的分泌物，刺激睑板腺使其形成肉芽肿，表现眼睑里面硬结疙瘩，与眼睑无粘连，可以是一个也可以是多个，可以反复发作，长期持续存在，长期持续存在可以压迫角膜，引起角膜散光，影响视力，多见于儿童。
目前没有特效药物治疗，可以使用黄降汞眼膏，囊肿内注射地塞米松治疗，小的通过热敷眼睛囊肿会自行吸收痊愈，大的手术刮出才行。睑板腺囊肿手术切口在睑结膜面，与睑缘垂直，使用刮出勺将分泌物刮出，分离睑板腺囊肿壁切除。