大便的颜色取决于大便中的色素，正常人大便的黄色来源于胆汁颜色。胆汁是肝脏分泌，由胆囊储存并排入肠管中，辅助消化脂肪类食物。食物中的色素也会影响大便颜色，如红色苋菜、红色火龙果可以使大便变成红色。
某些药物，如中药、铋剂可以使大便变成黑色。消化道出血时可根据出血量多少，使大便呈黑色或者红色。绿色大便可见于饮食中未被充分消化、吸收的叶绿素。
大便颜色出现改变应进行大便化验，如大便中无红、白细胞，大便潜血阴性则可放心。如大便潜血阳性应进一步检查，必要时需要完善胃镜、肠镜。