如果慢性扁桃体炎急性发作，可能会有咽部的疼痛、化脓、感染以及发热等症状。急性发作的时候还是以抗炎治疗为主，一般使用青霉素或者头孢类的抗生素。青霉素类的比如阿莫西林、阿莫西林克拉维酸钾，头孢类的可以口服头孢丙烯、头孢地尼或者是头孢克洛等。
如果发热较严重或者血象较高，也可以静脉使用抗生素。严重的发热、疼痛，也可以给予一定的非甾体类抗炎药，比如布洛芬等解热镇痛。如果是反复发生的慢性扁桃体炎，需要通过手术切除扁桃体，以防止长期复发，引起全身的系统性的损害。