体外冲击波碎石治疗的并发症如下：
1、血尿，体外冲击波碎石虽然是无创伤的治疗方式，但是对同一部位反复体外冲击波碎石，可以造成相应的黏膜损伤，造成出血，可以表现为尿液颜色发红。
2、出现输尿管狭窄，进行碎石过程中造成局部黏膜轻微损伤。如果反复进行同一部位的体外冲击波碎石，则可以导致局部黏膜形成瘢痕，故而造成输尿管管腔狭窄，就可以造成输尿管扩张或者肾积水。
3、肾脏纤维化，在体外冲击波碎石治疗肾脏结石，反复多次碎石以后可以造成肾脏损伤。在反复损伤与愈合的过程中形成纤维化，造成有效肾单位缺失，严重患者甚至造成肾功能不全的表现。
4、发热，往往见于治疗感染性结石，在体外冲击波碎石过程中，感染细菌播散进入血液之中，而造成患者体温升高。严重患者甚至可以形成感染性休克的表现，出现意识障碍、血压减低等。