双眼皮手术有可能会造成上睑伤口出血、血肿及皮肤瘀斑形成，也有可能造成伤口有感染等情况等发生。由于设计不当或者操作不当，可能会造成双侧重睑性不对称情况发生，也有可能一侧变浅或者消失，甚至上睑脂肪去除过多，而造成凹陷、三眼皮形成，脂肪去除过少造成一侧重睑变浅。
另外，上睑伤口也有可能有瘢痕增生，可以双眼皮拆线七天以后，早期应用一些抗疤药，尽量减少瘢痕增生，以达到比较好的双眼皮效果。双眼皮手术如果手术操作比较粗暴，也有可能有上睑下垂发生，需要再次进行手术矫正。