如果患者确诊为双肺的肺栓塞，临床上治疗比较困难，预后不是很理想，但有的患者也可以达到治愈的目的。当患者确诊为肺栓塞后，要根据病情考虑溶栓、抗凝、介入或者是手术的治疗方法，有溶栓适应症时首选溶栓治疗，常用的药物包括链激酶、尿激酶等，在溶栓的过程中需要复查凝血以及血小板的变化。
患者溶栓后或者是没有溶栓适应症时可以考虑抗凝治疗，常用的药物包括低分子肝素、华法林、利伐沙班、达比加群等，在抗凝的过程中需要注意监测凝血的改变，使国际标准化值维持在2-3倍之间。经过上述治疗无效或者是病情较重时，还可选择介入或手术的治疗方法。