牙周炎容易反复发作，所以治疗牙周炎必须要进行系统的治疗，要进行牙周炎的基础治疗，主要做龈上洁治、龈下刮治、根面平整的工作，通常需要1-2个月。
一般在基础治疗后的1-3个月开始进行手术治疗，需要对牙周的状况进行全面评估，有牙周袋探测出血现象，还需要进行进一步的治疗和控制。
牙周修复阶段，通常是在牙周手术后2-3个月进行，这时牙周组织的形态和位置已基本稳定，牙齿松动也做了固定，有特殊患者这时需要做正畸治疗。