霉菌孢子作为一个机会致病菌并不是由什么引起，而是在女性的阴道内或者人口腔、肠道内，都会有少量的寄生。大概10%-20%的非孕妇女，以及30%的孕妇，阴道中可能都黏附有假丝酵母菌，也就是霉菌的寄生，但菌量极少，大多是呈酵母相，酵母相也就是霉菌孢子，并不会引起炎症反应。
在无症状寄居或者传播中霉菌孢子起到了作用，当宿主全身以及阴道的局部细胞免疫力下降时，霉菌孢子会转换为菌丝相，大量繁殖、生长，侵袭组织，从而引起炎症反应。目前引起霉菌性阴道炎最常见的发病诱因，有长期运用广谱抗生素、妊娠、糖尿病、大量应用免疫抑制剂以及接受大量雌激素治疗等。胃肠道假丝酵母菌感染者粪便污染阴道，可以引起霉菌性阴道炎，穿紧身的化纤内裤以及肥胖，使外阴局部的温度和湿度增加，也是发病的影响因素。