相对于普通外科的手术肛瘘属于小手术，手术时间不是特别长，破坏的组织也不是特别多，属于一般体表的开放性小手术，虽然复杂性肛瘘处理起来要麻烦，但是创伤也不是特别大。但是肛瘘手术虽然是个小手术，但是并不比其它大手术忍受的痛苦小，因为处在肛门切口一般属于开放的，肛门周围的神经特别敏感，术后排便时会刺激伤口产生疼痛。另外肛瘘的愈合时间要长，因为切口不能缝合需要开放引流通畅让它不断生长，一个多月的时间才能够长好，所以虽然是个小手术，但是比较麻烦，而且疼痛也比较痛。