判断是肉芽还是疣，这个要根据病史、临床表现和相关的辅助检查来综合判断。
肉芽常常是指局部在损伤之后修复过程中所形成的一些肉芽组织，由疏松的结缔组织和新生血管所组成。
而疣通常是指人乳头瘤病毒感染所引起的病毒性的皮肤疾病，表现为皮肤上的新生物，往往具有传染性。可以是寻常疣、扁平疣，还有就是脚底部的跖疣以及尖锐湿疣。
比较容易混淆的，就是常在外阴部的尖锐湿疣和局部的肉芽组织。
首先是尖锐湿疣有不洁的性接触性行为的病史，同时局部的病变往往刚开始使淡红色的肉芽状，但可以逐渐生长颜色变成污灰色的乳头瘤状、鸡冠状或者是菜花状。
另外，通过醋酸白试验或HPV基因检测，也是能够区分肉芽和尖锐湿疣的。