献血合格也不能百分之百地排除HIV病毒感染。因为在献血的时候，是检测的HIV特异性抗体，当抗体是阴性结果时初筛合格，抽取的血液也还要进一步的筛查。HIV病毒侵入人体后，会刺激机体免疫反应，产生特异性抗体。但是感染了HIV病毒，通过试剂检测，不会马上查到HIV特异性抗体，因为HIV抗体的检出需要有一定的窗口期。窗口期是指HIV病毒侵入人体之后，产生抗体达到足够量，能够被检测试剂所能捕捉到的这段时间，称为窗口期。所以在窗口期时，虽然HIV抗体检测不到，但是可能是存在着HIV病毒。
通过HIV核酸检测或者抗原检测，能够证实病毒的存在，而且此期也是具有传染性，所以即使是献血时被告知合格，之后进行血液后期筛查时，也可能被筛查出来。因为献血时可能是处于艾滋病的窗口期，抗体没有检测出来，所以才是阴性结果，因此，被告知献血合格，所以在窗口期时，HIV抗体阴性结果不能完全排除HIV病毒感染。