根管治疗失败的原因有很多：第一个原因有可能是遗漏根管。由于医生对患者牙体解剖形态不够熟悉，在治疗过程中遗漏了根管，导致根管治疗后牙齿再次疼痛，这种情况需要再次进行根管治疗。第二个原因可能是由于在治疗过程中感染没有彻底的控制住。没有将根管内的细菌全部去除，就进行了根管充填，使之后残余牙髓的感染细胞再次滋生，从而导致根管治疗失败，患者再次感觉疼痛。第三个原因有可能是因为根管治疗以后没有进行根尖手术。对于根尖有大面积病变的囊肿，根管治疗后还需要再进行根尖手术，把根尖的囊肿以及肉芽肿去除以后，才能完成彻底的治疗。