卵巢囊肿检查的最佳时间，只要不是月经期都可以去检查是否有卵巢囊肿，一般是做阴超检查。如果发现卵巢有囊肿，首先要观察2-3个月，如果三个月后卵巢囊肿消失，证明是生理性囊肿，则不需要处理。
如果卵巢囊肿没有消失，需要做肿瘤标志物测定，如果肿瘤标志物测定正常，囊肿直径小于4cm，可以观察。如果在观察的过程中囊肿增大，需要做手术，因为卵巢囊肿有可能恶变。如果卵巢囊肿是子宫内膜异位囊肿，囊肿有可能影响生育，所以希望生育的女性尽快安排怀孕的时间，如果一年以上不怀孕，要到医院及时就诊。