酮替芬和氯雷他定都有抗过敏的作用，但二者的作用机制、起效时间、适应症以及可能出现的不良反应都有所不同。酮替芬属于致敏活性细胞，如肥大细胞或嗜碱性粒细胞的过敏介质释放抑制剂，具有保护肥大细胞或者嗜碱性粒细胞的细胞膜，使之在变应原攻击下减少膜变构，减少释放过敏活性介质的作用。
此药兼有较强的H1受体拮抗作用，也可以看作是抗组胺药，对于预防各种支气管哮喘的发作，外源性哮喘治疗比内源性哮喘治疗效果更好。此药起效较慢，对于支气管哮喘的缓解作用，一般需要连续用药2-4周后方可逐渐显现。氯雷他定属于选择性外周H1受体拮抗剂，起效快，用于缓解过敏性鼻炎有关的症状，需要合理选择使用。