肝癌晚期可以做粒子治疗，但粒子治疗只是肝癌治疗其中的一种手段，一旦确诊肝癌，应根据肿瘤大小、部位、有无肝内外转移、患者全身状况等，选择合理的肝癌个体化治疗方案。手术切除仍然是治疗肝癌最有效的手段，但大概有95%的肝癌病人在诊断时已失去手术机会。
对于难以手术切除的中晚期肝癌，采取肝动脉灌注化疗栓塞术，或采取肝动脉和门静脉双重化疗栓塞术会有较好的疗效。另外，针对肝功能Child分级，A级或B级病人可给予分子靶向药物治疗。索拉非尼曾是我国唯一获批用于治疗晚期肝癌的药物，至2018年，靶向药物阿法替尼在我国也获批用于治疗晚期肝细胞癌，为肝癌患者提供了新的选择。最新国内外肝癌治疗指南提到的肝癌根治术中，包括射频治疗、手术切除、肝移植、介入治疗、TACE治疗，但以上根治术中不包含粒子的置入治疗，故粒子可以作为其中的一项辅助治疗。