小结石在临床上多采用非手术治疗，如果患者没有明显的症状，或者是没有肾积水、梗阻的表现，一般采用等待、观察，平时生活当中纠正结石的易发因素。根据24小时尿成分分析，以及血生化检查的结果，调整饮食结构和饮水习惯，控制体重，使24小时尿量维持在2000mL以上。
对于高尿钙患者应该限盐，保证每日钙的摄入量大约1000mg，少吃富含草酸的食物，适当进行运动。如果出现症状，或者结石增大、造成梗阻，需要采用外科治疗的措施。外科治疗小结石可以采用体外碎石，或者是输尿管软镜碎石取石术。