多囊卵巢通常不会诱发卵巢早衰，卵巢早衰是40岁以前，由于卵巢内卵泡的耗竭或被破坏，甚至手术切除卵巢而发生的卵巢功能衰竭，称为卵巢早衰。卵巢早衰外观多呈萎缩状，多数患者无明确诱因，属于特发性病变。有一部分患者是由于自身免疫性疾病，所引起的自身免疫性卵巢炎导致。另外，盆腔放疗或全身化疗，对卵母细胞损害作用，也是导致卵巢早衰一项非常重要的原因。
而多囊卵巢是由于卵巢内有多个卵泡发育，并不能完全成熟，导致卵巢的排卵异常，多数会引起月经改变、异常子宫出血，以及子宫内膜病变。所以，跟卵巢早衰没有明确关系。卵巢早衰使卵巢外观多呈萎缩状，女性卵巢分泌性激素功能衰竭，导致促性腺激素水平升高，80%以上的患者会有潮热、出汗等绝经过渡期症状，需要给予药物替代治疗，以缓解绝经过渡期症状，有效预防骨质疏松及心脑血管意外的风险。