胸腺肽是免疫调节药，具有调节和增强人体细胞免疫功能的作用。胸腺肽主要用于下列患者，包括用于慢性乙型肝炎患者，各种原发性或继发性T细胞缺陷病，如儿童先天性免疫缺陷病，用于某些自身免疫性疾病，如类风湿性关节炎、系统性红斑狼疮、儿童支气管哮喘和哮喘性支气管炎等。
胸腺肽还可以用于各种细胞免疫功能低下的疾病，如病毒性肝炎，预防上呼吸道感染、顽固性口腔溃疡等，还可以用于辅助治疗肿瘤。对于器官移植的患者应禁止服用胸腺肽，正在接受免疫抑制治疗的患者应慎重使用胸腺肽。