女性如果发生了卵巢早衰，合并有一系列的精神神经症状以及泌尿生殖道的一系列临床表现，此时就需要给予药物治疗，如一般的处理，应该对患者进行神经精神病疾病的疏导，嘱患者注意调节饮食，加强营养。还需要根据卵巢早衰导致的雌性激素水平低下而引起的一系列症状，就需要给予补充一定量的雌激素和孕激素。
对于有子宫的患者要补充雌激素的同时加用孕激素，来保护子宫内膜。对于切除子宫的患者，仅需要给予补充雌激素就可以。此时补充雌孕激素之前，一定要了解患者有没有应用雌激素和孕激素的禁忌症，也就是近期内有没有雌激素依赖性肿瘤的发生，还有没有活动性的血栓病史来综合判断。另外，也可以用纯中药制剂或者纯植物性的药物，来缓解因卵巢早衰引起的低雌激素症状。