肠胃炎低烧是否会自愈，要看引起低烧的原因，具体如下：
1、细菌病毒感染引起，症状比较轻微，患者没有出现高热，没有出现剧烈的腹痛、呕吐、腹泻等等症状，经过适当的饮食调理，进行物理降温，肠胃炎的症状可以得到更好的好转，就可以治愈；
2、伴有剧烈的呕吐、腹泻，导致出现有脱水表现，严重的患者出现了低血容量性休克，需要尽早到医院就诊，完善血常规、便常规的化验，也需要尽快的建立静脉通道，静脉输液，补充水分和电解质，抗休克治疗。