拔大牙可能出现的后遗症有牙槽骨缺损、邻牙或对颌牙损伤、神经损伤，如果是上颌的后牙，还有可能出现上颌窦瘘。拔除大牙，也就是磨牙，有可能会造成术中或者是术后的并发症。
有一些并发症慢慢的可以恢复，有一些不能恢复，会形成后遗症，例如可以出现部分的牙槽骨缺损，常常发生在拔上颌智齿，或者有些牙齿由于长期的炎症，与牙槽骨广泛粘连，无法分离，拔牙的时候会造成牙槽骨脱落，造成牙槽骨损伤。还可以造成邻牙和对颌牙的损伤，尤其是有全冠修复或者牙齿部分缺损，有可能会造成修复体脱落、邻牙牙体的损伤。拔下颌智齿常常会出现下槽神经或舌神经损伤，出现下唇麻木、舌麻木。拔上颌的后牙，有的牙根位于上颌窦内，拔牙以后可能会造成上颌窦瘘。