直肠炎可以口服美沙拉嗪或者使用甲硝唑、康复新液等药物灌肠治疗，美沙拉嗪对于肠道系统炎症具有治疗的作用，服用后能抑制前列腺素的合成，并且对炎症介质白三烯具有抑制的作用，对于慢性结肠炎和直肠炎的治疗效果不错，但由于药物中含有水杨酸的成分，因此对于水杨酸有过敏反应的人禁止使用。直肠与肛门的部位相对比较接近，因此在治疗时也可以通过灌肠的方法进行治疗。灌肠治疗时可以使用甲硝唑结合康复新液治疗，甲硝唑药物在灌肠时能消除直肠部位的炎症，而康复新药物具有通利血脉、养阴生肌的功效，可以促进直肠黏膜的恢复。在用药治疗期间还应保持大便通畅，尤其避免出现便秘。