先天性扁桃体肥大的治疗，需要根据扁桃体肥大的具体程度以及对患者所造成的影响程度，来决定相应的治疗处理措施，具体如下：
1、单纯性先天性扁桃体肥大：如果患者只是单纯存在先天性扁桃体肥大，平常咽喉部并没有特殊的不适症状及感受，扁桃体的肥大状况也没有对患者的呼吸通气造成明显的不良影响，没有出现明显的打呼噜以及张口呼吸的表现，不需要特殊的治疗或处理；
2、扁桃体肥大伴咽腔狭窄：如果患者扁桃体肥大的状况造成了咽腔狭窄，引起患者出现明显的咽喉部堵塞感、异物感的症状及感受，或者造成患者晚间睡眠时出现较为严重的打呼噜、长时间张口呼吸的表现，需要酌情选择进一步手术治疗。