褐色痰可以见于长期吸烟、呼吸系统感染性疾病、咯血的患者，因此如果出现褐色痰，一定要去医院就诊，通过肺部CT等检查进一步明确诊断，以明确肺部是否有结构性的改变。
如果是呼吸系统感染性疾病的患者，常常会有吸烟的患者并发细菌感染，可予以抗感染治疗，如青霉素类的阿莫西林或阿莫西林克拉维酸，大环内酯类的阿奇霉素或者是红霉素，头孢菌素类的头孢羟氨苄、头孢呋辛、头孢地尼等。如果是大于18岁以上的患者，也可以给予喹诺酮类的抗生素，如莫西沙星、甲磺酸、左氧氟沙星等进行抗感染治疗。
咯血的患者也可以看到褐色痰，一般是由于血液较长时间存在于气道，所以咯出后不是鲜红色而出现褐色痰。可见于鼻部的出血倒流入咽部或者是咽部本身的出血，还可见于肺部病变，如肺结核、支气管扩张、肺拴塞、肺部恶性肿瘤等。治疗除了对症止血治疗以外，肺结核还要进行规律的抗结核治疗。支气管扩张咯血一般由于感染或者毛细血管破裂引起，治疗一般予以抗生素抗感染治疗。肺栓塞可以给予抗凝治疗，必要时溶栓或者是手术取栓治疗，肺部恶性肿瘤根据不同的病情可以给予手术切除，放、化疗，靶向治疗等。因此，出现褐色痰一定首先去医院进一步检查，明确病因，及时治疗。