新生儿窒息的处理首先是早期在产房内的处理，即新生儿娩出之后要立即进行初步复苏，给予新生儿保暖、摆正体位以及必要的时候做气道的清理。
在初步复苏之后，如果新生儿还是有呼吸和循环的问题，可以进行正压通气，甚至要做气管插管或者心肺复苏，也就是胸外外按压等等，在产房内复苏稳定之后可以转入新生儿科进行窒息复苏后的相关的处理，主要是早期进行亚低温治疗。
如果新生儿没有出血的话。如果有消化道出血、肺出血、凝血不好等亚低温治疗的相关的禁忌症，一定要在生后的6小时之内，早期进行亚低温治疗，可以最大程度的降低新生儿对窒息之后引起的脑损伤。
在新生儿期后主要是针对窒息引起的相关脑损伤并发症的处理，可以早期做康复治疗。