化脓性扁桃体炎一般需要与以下两种疾病相鉴别：
第一、与咽白喉鉴别，咽白喉是急性传染病，主要表现为咽部粘膜形成灰白色的假膜，一般是需要通过鼻咽的试纸、培养找到白喉杆菌进行确诊。
第二、与粒细胞缺乏性的咽峡炎鉴别，主要表现为起病急多伴有高热、精神萎糜、迅速出现衰竭状态，局部伪膜可能变成灰绿色坏死组织，而且在假膜下面会有溃疡形成，抽血化验之后患者的血白细胞数极低，建议一定要明确诊断，避免耽误患者的病情。