寻常疣的治疗方法主要分为外用药物治疗、局部注射治疗和物理治疗三个方面。具体哪种治疗方法最佳，要根据患者的具体情况，疣体的大小、多少，既往的治疗，反应情况，综合决定治疗方案，选择最适合的才是最佳的。
第一、外用的药物主要包括维A酸软膏、肽丁胺霜，还有五氟尿嘧啶软膏，通过局部涂抹可以让疣体变平、去除。除此之外，还有咪喹莫特软膏，还有鬼臼毒素都有治疗寻常疣的作用。
第二、除了外用药之外，还可以皮损内注射，就是在疣体的根部注射平阳霉素，注射干扰素，就是五氟尿嘧啶注射液，也有去除疣体的作用。
第三、就是物理治疗，包括冷冻、电解、二氧化碳激光、电灼、高频电刀刮除这些方法，适合皮损数目较少的。除了这些之外，对于顽固的皮损面积大的，还可以采用光动力方法去治疗。