神经衰弱的治疗主要以心理治疗为主，如果患者有焦虑、抑郁、睡眠障碍等明显的症状，可以给予相应的药物治疗，常用的治疗药物有帕罗西汀、氟伏沙明、西酞普兰、文拉法辛等。此外，还可以应用安眠药物，比如佐匹克隆、右佐匹克隆和地西泮等。
如果患者情绪精神障碍明显，还可以应用米氮平、多塞平、曲唑酮等，但是为了防止这类药物的依赖成瘾，应该短期交替使用。如果患者有明显的抑郁、焦虑和兴奋性特性，还可以应用氟哌噻吨美利曲辛，该药物已经广泛用于治疗神经衰弱的症状。