消化道出现念珠菌感染会伴随吞咽困难、食欲不振、胃部烧灼、腹泻等症状，念珠菌对消化系统造成感染时会诱发消化系统方面的症状。当患者的食管黏膜受到念珠菌感染时会出现食管部位的水肿、充血，这类患者在日常饮食上会表现出吞咽困难等现象。念珠菌对胃黏膜造成影响时会诱发胃炎、胃溃疡等疾病，患者不仅会出现胃部发胀、食欲不振，同时还会出现胃部疼痛感。念珠菌感染会导致胃酸分泌过多，所以不少人还会因此出现胃部烧灼感。当肠道系统受到念珠菌感染时肠道系统的吸收和消化功能都会受到影响，会出现腹痛、腹泻等症状，长期还会表现为营养不良。