怀孕16周引产的程序如下：第一、患者需要到女方所在当地计生办开引产证明，证明患者是意外怀孕，或者是因为胚胎发育畸形等必须要做引产。没有引产证明，医院是不会给做引产的。第二、患者需要住院，住院完善血液、彩超以及妇科、白带等相关检查，排除引产的禁忌，然后签署引产的知情同意书。第三、根据患者的综合情况确定引产的程序，比如选择水囊引产、宫腔内注射利凡诺引产。确定引产的方式之后，就需要用药，用药之后患者会出现胚胎的死亡、子宫的收缩，同时患者的胚胎或者是胎盘会排出宫腔，达到引产的目的。第四、引产之后，患者多有宫腔内绒毛膜的残留，所以这种情况下多需要行清宫手术。清宫手术之后，如果患者没有异常不适，流血不多，那么就可以出院。