女性由于尿道短，常常会导致尿道逆行感染，引起女性尿道炎。由于在性生活时，女性尿道短，尿道外口距离阴道较近，在性生活时男性经常会将龟头包皮垢传染给对方。引起女性尿道口逆行感染，导致女性尿道炎发生。
女性尿道炎还由于女性处女膜破裂时，会出现处女膜伞覆盖尿道，常常导致尿道外口出现残余尿，会出现反复尿液感染，导致女性尿道炎反复发作。女性尿道炎还由于女性有尿道憩室感染，当尿道憩室反复发生感染时，容易导致尿道炎发生。