39岁闭经以后可以采取以下几种方法来进行治疗：
第一、去医院进行检查，判断是什么原因引起的停经。若是由卵巢功能早衰引起的，需要及时去医院进行性激素六项，以及抗缪勒氏管激素检测、B超检测，观察身体情况，可以使用雌激素类药物进行治疗，比如使用黄体酮或达英-35等药物进行治疗都是可以的。若是高泌乳素血症引起的，要排除垂体微腺瘤，可以口服溴隐亭，必要时进行手术治疗。
第二、可以采取手术方式进行治疗，若是由于宫颈粘连、宫颈闭锁或子宫内膜过薄等问题导致，可以采取手术切除方式解除宫腔粘连。
第三、采取心理治疗，很多女性闭经可能是由于心理压力过大或其他因素引起，建议及时进行心理疏通。若有贫血问题，最好及时服用补血药物进行治疗。