当患者的牙齿发生根尖周炎时，早期慢性的根尖周炎不建议吃药来解决问题或治疗疾病，根尖周炎发生以后需要进行根管治疗术。根管治疗术包括根管预备、根管消毒和根管充填三大步骤，简单的说就是需要复诊几次，取出牙齿内部牙髓腔内的发炎牙髓组织，并进行彻底的清创、预备，并最后进行严密的充填，防止牙齿再感染，对根尖周炎能起到治疗作用。
如果不去除发炎的牙髓组织，吃消炎药起不到作用，所以当牙齿发生根尖周炎时先要进行治疗。当急性根尖周炎发作时，在局部治疗的同时，可以辅助吃消炎药，消炎药推荐头孢类消炎药和甲硝唑。