射频消融手术治疗的价格与手术的复杂程度有关，如果是因为阵发性室上性心动过速而做的射频消融手术，仅仅用二维系统，费用在2万元左右。如果是因为心房颤动而做的射频消融手术，需要应用三维导航系统及房间隔穿刺耗材，手术费用在6万元左右，具体价格波动和不同的医院和医疗机构而异。
另外，如果术前生命体征不稳，或者术后出现感染、心律失常、心力衰竭等并发症，围手术期需要再加上1-2万元。术前、术后的用药是可以按照比例报销的，但是单纯的射频消融手术耗材的费用是不能报销的，具体价格还需要看当地的医保政策。