肾囊肿手术复发率低的手术方式就是经过肾脏囊肿的完全切除，将肾脏囊肿的包膜完全剥离，但是这种情况损伤比较大。临床上对于现状囊肿所采取的手术方式，需要根据肾脏囊肿的性质来进行决定，如果肾脏囊肿在B超上显示是1级或者2级，那就是良性病变，当直径<5cm的时候需要动态观察，当直径>5cm的时候，在B超引导下做穿刺、抽液处理即可。
如果在B超上显示是2F级、3级或者4级，有可能就是恶性病变，需要作肾脏强化CT来进行确认。如果确认以后是恶性病变，需要将肾脏囊肿全部切除，包括肾囊肿的包膜，这样才能使病变彻底的消失，有利于身体的健康。