早期进食食物后或清洁掉牙齿以后，唾液中的唾液薄膜以及各种蛋白，会沉积在牙齿表面形成获得性膜，口腔中的细菌会附着在获得性膜上形成牙菌斑。
牙菌斑形成以后，经过一段时间会由于唾液中的钙盐、磷等沉积而钙化，钙化以后会形成牙结石，早期的牙结石是黄色的，时间越长牙结石颜色变得越黑并且质地较硬。
牙结石形成以后，主要沉积于牙龈缘的腹肌以及牙龈下方、牙根面。
牙结石的形成是促进牙周组织破坏的重要原因，因为牙结石中含有大量的细菌，所以应定期的清除掉牙结石。
牙结石形成后并不能通过刷牙、漱口的方式去除，所以建议半年左右到医院进行一次洁治，去除牙龈缘附近的牙结石，如果有牙周病更要积极的进行系统治疗。