肝癌最常见转移部位是侵犯门静脉主要分支或侵犯肝静脉，在门静脉和肝静脉内可以形成癌栓。一旦出现癌栓形成，往往预示着肝癌已经失去了根治性手术切除机会，处在相对晚期阶段，该部分患者常会伴有周围淋巴结或远处器官扩散等现象。
除了肝癌细胞侵犯门静脉、肝静脉之外，肝癌还常合并局部淋巴结转移。既包含肝门周围淋巴结，也包含腹膜后淋巴结，一部分肝癌患者还可以出现远处器官转移，比如肺脏、骨骼等部位，都是肝癌常常发生血行转移的部位。