通常如果早期的乳腺低分化癌的病人，首先应进行根治性手术切除，在术后根据病理回报结果，进行辅助治疗，比如对激素受体阳性的乳腺癌病人，可以先进行术后辅助的化疗，化疗后采用辅助内分泌治疗的手段，进一步延缓术后复发的现象发生，延长病人生存时间。如果乳腺低分化癌，病理回报HER-2基因呈现阳性，可以采用针对HER-2基因的靶向药物治疗。
如果是低分化三阴性乳腺癌的病人，在手术后主要是采用化疗为治疗手段，如果低分化乳腺癌病人在手术前已经发现伴有同侧腋窝淋巴结的转移，不适合进行彻底手术切除，可以先进行术前辅助化疗，使淋巴结转移病灶或者缩小、控制，争取更大程度根治性手术切除的机会。而在手术治疗后，需要根据术前治疗的情况以及病理回报结果，选择补充后续的术后辅助化疗，从而进一步延长病人生存期。