原发性肝癌根据不同的分期，需要进行个体化的综合治疗，才能提高疗效，所有的治疗方案包括手术、肝动脉化疗栓塞、射频消融、微波消融、冷冻、激光，还有全身化疗、放射治疗、靶向治疗、免疫治疗，以及中医中药治疗。手术是治疗肝癌的首选方法，也是最有效的方法，可以采用根治性的切除，也可以采用姑息性切除，不能切除的肝癌患者，可以采用射频、微波、冷冻等治疗方法。
化疗就是通过切除以后经肝动脉插管到肝脏，采用化疗药物对肝癌的原发部位进行治疗的方法。放射治疗对肝功能好、没有肝硬化、黄疸、腹水可以采用放射治疗。此外，还有分子靶向药物治疗、免疫治疗等先进的治疗方法，都可以作为治疗肝癌的首选方案。