宝宝得了疱疹性咽炎，需要进行对症治疗。如果患儿发烧，体温达到38.5℃以上，伴有明显不适，需要降温治疗。除了进行物理降温以外，还可以给予退热药进行降温，常用的退烧药有布洛芬、对乙酰氨基酚等。但需要注意的是两次用药时间最短间隔4-6个小时，24小时之内不超过四次。
如果患儿发升高热惊厥，需要及时进行止惊治疗，常用的药物为咪达唑仑、水合氯醛。病因治疗，目前没有特异性的抗病毒药物，中医治疗可根据中医理论辨证治疗。发热出疹期，患儿以清热解毒、祛湿为主。退热消症期患者余邪未净、气阴两伤，治疗以清热除湿、益气养阴为主。