化脓性扁桃体炎的病因是由于各种致病微生物引起的腭扁桃体的急性化脓性炎症。
临床上常见的上呼吸道感染性疾病常伴有不同程度的咽部黏膜和淋巴组织炎症，病原体多为溶血性链球菌，其次为流感嗜血杆菌、肺炎链球菌、葡萄球菌等。
以春秋两季多见，常在体温变化、劳累、受寒等免疫力下降时发生。
儿童和青少年是其高发人群，临床特点为起病急、咽疼明显，多伴有高热，体温高达39℃以上，容易反复发作。
腺病毒也可以引起本病，细菌和病毒混合感染也不少见，细菌可能是外界侵入的，也可能是隐藏于扁桃体腺窝内的细菌。
当机体抵抗力下降、劳累、受凉、体质虚弱、烟酒过度、有害气体的刺激时，细菌繁殖加强，可导致化脓性扁桃体炎。