新生儿循环系统的特点主要是从胎儿循环过渡到正常新生儿出生以后的体循环，循环的过渡在早期有可能会发生持续胎儿循环，特别是有肺动脉压和肺血管阻力增高，会导致右向左的分流，引起新生儿发生青紫。
但大部分新生儿，尤其是足月的新生儿，随着出生以后日龄的增加，动脉导管和卵圆孔逐渐关闭，由原来的右心占优势变为左心占优势。如果有动脉导管未闭，此时的血流方向主要是左向右分流，所以尤其是在早产儿，一旦有左向右分流，动脉导管比较粗大，可能会导致新生儿发生肺水肿或者肺血增多，引起呼吸困难。随着日龄的增加，当动脉导管关闭之后，就回归到正常的体循环，此时新生儿就没有明显的青紫和呼吸困难的表现。