胆管错构瘤可以分为实性为主，囊实性囊性为主，在CT的表现中有所差异，在平扫时一般是等密度或者低密度影，大部分是低密度影，从囊性到实性。
增强扫描因为囊实性的不同，有所差异，囊性为主的，没有明显的强化，实性为主的增强有强化，有的强化后可以变成与肝脏等密度，少部分的患者也可以呈现环形的强化。
在磁共振的表现中，T1、T2下有所差异，其中T1下的信号是升高的，接近于脑脊液，而T2像略有下降，MRCP显示酶与胆管是没有明显的相通的，在强化上可以没有强化，也可以是均匀的强化，边缘的强化或者壁结节的强化具体要根据错构瘤内的囊实性组织的比例有所差异。