新生儿梅毒抗体两阳性就是指特异性抗体阳性，非特异性抗体也是阳性，其中特异性抗体阳性可以作为诊断梅毒的依据，因为梅毒螺旋体侵入人体之后，在血清当中可能出现梅毒螺旋体抗体，并可以终身存在，所以如果特异性梅毒螺旋体抗体阳性，就意味着患者现在感染了梅毒。非特异性抗体阳性时也支持梅毒的诊断，而且滴度的变化可作为疗效观察的指标。
新生儿如果非特异性抗体和特异性抗体两项都是阳性，就需要进行治疗，目前青霉素类药物是治疗梅毒的首选药物，可用于各期的梅毒患者，应遵循及早、足量、规范的治疗原则，早期的梅毒可以治愈，治疗之后定期检查、随访是监测和保证治疗效果的重要环节。