腮腺炎合并睾丸炎时，有极个别的患者可能会出现睾丸萎缩而影响生育。感染腮腺炎病毒之后，病毒不仅会伤害腮腺，有时还可以侵犯胰腺、卵巢、睾丸等，所以可以出现合并症，如脑膜炎、脑膜脑炎、胰腺炎、睾丸炎、卵巢炎等。
腮腺炎的主要临床表现是胰非化脓性的腮腺肿胀为主要特征，以耳垂为中心，向前、向后、向下肿胀，通常是一侧先肿胀，之后波及另一侧。目前对于腮腺炎病毒没有特效的抗病毒药物，主要是以对症治疗为主，如果出现高热时可以物理降热或者是药物降热，腮腺肿胀、疼痛时可以给予镇痛药。