儿童蛋白尿一般考虑有肾脏的疾病，很大的可能是肾病综合征。肾病综合征是由于肾小球滤过膜受到损伤，对血浆蛋白的通透性增高，导致儿童出现大量蛋白尿、低蛋白血症、水肿、高胆固醇血症为特征的一组临床综合征。肾病综合征可以分为原发性、继发性和先天遗传性，有三种类型。
肾病综合征主要依靠激素、免疫抑制剂进行治疗，治疗的周期比较长，一般在半年到一年以上。如果肾病综合征在急性期，存在有少尿、高血压、电解质紊乱的状态，需要控制饮食中盐的摄入，控制水和电解质的摄入量，防止感染，适当的利尿，并且应用糖皮质激素等免疫抑制剂进行治疗。