生殖器疱疹的溃疡，一方面可以使用抗病毒的药膏，比如阿昔洛韦软膏、喷昔洛韦软膏、干扰素凝胶等，也可以使用预防感染的药膏，比如莫匹罗星软膏、夫西地酸乳膏等，来预防继发细菌感染。生殖器疱疹是由单纯疱疹病毒感染，所引起的一种性传播疾病，主要通过不洁的性行为、性接触感染疱疹病毒，然后引起局部出现群集性水疱，很容易糜烂，会形成小的糜烂面或者浅溃疡。
在治疗方面使用抗病毒药物治疗，包括内服的抗病毒药物，比如阿昔洛韦、伐昔洛韦、泛昔洛韦、更昔洛韦等，局部可以外用抗病毒的药膏。有时候也可以使用无菌的生理盐水等，清洁局部的糜烂面和溃疡，同时加用抗菌的软膏来预防感染，促进愈合。