甲状腺疾病可以看内分泌代谢科、核医学科、普外科或耳鼻喉科等，具体看哪个科室要看患有哪种疾病，甲状腺疾病是各种病因导致的甲状腺形态、组织结构、功能发生异常的一大类异质性甲状腺疾病病谱，包括了较多的具体甲状腺疾病，从病因上包括了Graves病、自身免疫性甲状腺炎、甲状腺腺瘤、甲状腺癌、单纯性甲状腺肿、药物或手术对甲状腺的损害等。
从功能上分为甲状腺功能亢进症和甲状腺功能减退症，不同的病因和功能状态需要到不同的科室去就诊，比如Graves病使用抗甲状腺药物治疗或者甲状腺功能低减使用甲状腺药物治疗等，需要到内分泌代谢科就诊，Graves病用碘-131同位素治疗时，需要到核医学科或内分泌代谢科就诊。Graves并手术治疗需要到普外科或耳鼻喉科就诊，所以甲状腺疾病要到哪些科室就诊需要看具体是哪种甲状腺疾病。